Группы согласных ( в том числе удвоенные согласные ) обозначаются сложными знаками – лигатурами.
Лигатуры могут строиться по вертикали или ( чаще ) по горизонтали. В первом случае знак первого из входящих в сочетание согласных звуков пишется полностью, а снизу присоединяется характерная часть знака другого согласного, напр. द्व два, न्न нна. В горизонтальных лигатурах полностью обозначается второй согласный и впереди присоединяется характерная часть знака предшествующего согласного, напр. त्प тпа,
प्त пта, ग्न гна, म्ह мха. Также строятся и тройные лигатуры, напр. त्स्न тсна.
Сочетания согласных можно обозначать также полными знаками согласных со знаком «вирам» (знак отсутствия гласного), однако этот способ обычно применяется только в случае неудобства составления лигатур, напр. शट्कोण шат-кон – шестиугольник.
В некоторых лигатурах характерные части составляющих букв значительно видоизменяются, напр. त्त тта, त्र тра, द्द дда, द्म дма, द्य дйа, द्ध ддха, ह्म хма, ह्य хйа. Необычную форму принимает знак श ш перед знаками некоторых согласных, напр. श्र шра (вертикальная лигатура).
Особую форму в лигатурах принимает знак сонанта р. В сочетании с предшествующими согласными он представляет черточку внизу ( / ), напр. क्र кра, द्र дра, ब्र бра, श्ट्र штра,
स्र сра.
Если р произносится перед другими согласными, он обозначается значком , который ставится сверху правее всех остальных надстрочных знаков, относящихся к данному слогу, напр. र्क рка, र्श्व ршва.